正确答案：司马懿；

答案解析：司马懿是正确答案，因为他和他的两个儿子司马师和司马昭一起围困了诸葛亮于上方谷。其他选项不正确的原因如下：

A. 司马懿和司马懿的儿子司马师和司马昭一起围困了诸葛亮，司马懿并没有父子关系。

C. 司马懿和司马懿的儿子司马师和司马昭一起围困了诸葛亮，司马昭并不是司马懿的父亲。

D. 司马懿和司马懿的儿子司马师和司马昭一起围困了诸葛亮，司马炎并不是司马懿的儿子。