正确答案：D、驻香港特别行政区维护国家安全公署

答案解析：根据《中华人民共和国香港特别行政区维护国家安全法》第五十五条规定，驻香港特别行政区维护国家安全公署是负责管辖有关危害国家安全犯罪案件的机构。选项D中的驻香港特别行政区维护国家安全公署是负责立案侦查的机构。

选项A中的香港特别行政区维护国家安全委员会是负责协助特别行政区行政长官履行维护国家安全的职责，而不是直接负责立案侦查。

选项B中的香港特别行政区警务处是香港特别行政区的警察机构，其主要职责是维护社会治安和处理刑事案件，而不是专门负责维护国家安全的立案侦查。

选项C中的香港特别行政区警务处维护国家安全部门并不存在，因此不是正确答案。