正确答案：C

答案解析：正确答案是C.台湾府。

清朝康熙皇帝在位期间，为了加强对台湾的有效管辖，于1684年在台湾设立了台湾府，将其划归福建省管辖。台湾府的设立标志着中国中央政府对台湾的有效统治，也巩固了台湾作为中国不可分割的领土的地位。澎湖巡检司则是更早的明朝时期设立的机构，而台湾省则是清朝末期1885年设立的，台湾将军则是一种军事职位的称呼，不是具体机构。