谜语解析：这个谜语的解答是巧妙的，谜面“研制新产品的基金被替换（皮包公司广告）”暗示了一个关键信息：基金被替换，即资金被挪用或虚假操作。结合谜底“代开发票”，我们可以这样解读：

- “研制新产品”的“新”字去掉“心”部分，变成了“开”，暗示着开发或操作。

- “基金被替换”中的“替换”在这里可以理解为“代开”，即代替开票。

- “皮包公司广告”进一步强调了这是虚假的行为，因为皮包公司通常指的是没有实际业务，只是通过虚假交易来骗取资金的公司。

所以，谜底“代开发票”巧妙地揭示了谜面中的关键信息，即资金被挪用，通过虚假开票的方式来骗取资金。