正确答案：国家安全机关

答案解析：选择A.国家安全机关的原因是因为反间谍工作属于国家安全范畴，国家安全机关是负责维护国家安全和防范间谍活动的专门机关。

国家安全机关是中国共产党和国家机关的重要组成部分，主要负责侦察、反间谍、保密、反恐怖等工作。其职责包括收集、研究、分析国家安全领域的情报信息，开展反间谍、反恐怖等工作，保护国家机密和重要涉外信息，维护国家政治安全、社会稳定和经济发展。

国家安全机关在反间谍工作中扮演着重要角色，通过侦察和情报工作，及时发现和打击境内外敌对势力的间谍活动，保护国家利益和安全。选择A.国家安全机关作为主管反间谍工作的机关是符合实际情况的。